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マイトマイシン C は、その抗腫瘍活性により化学療法剤として使用されるマイトマイシンです。

上部消化管癌（食道癌など）、肛門癌、乳癌の治療には静脈内投与されるほか、表在性膀胱腫瘍の場合は膀胱点滴注入も行われます。

マイトマイシン C は、がん、特に膀胱がんや腹腔内腫瘍に使用されます。

マイトマイシン C は眼科手術で使用されます。マイトマイシン C 0.02% は、緑内障フィルター手術中の瘢痕化を防止し、PRK または LASIK 後のかすみを防ぐために局所的に適用されます。マイトマイシン C は、斜視手術における線維症を軽減することも示されています。

マイトマイシン C は、食道および気管の狭窄に使用されます。拡張直後の粘膜にマイトマイシン C を塗布すると、線維芽細胞および瘢痕組織の産生が減少するため、再狭窄が減少します。